堀越学園理事長の堀越克明により、多摩地区では数少ない男女共学の進学校として、まず高等学校が１９８５年に、次いで中学校が１９８７年に開設された。２００７年から高校募集を停止して、完全中高一貫校となった。
校名の１字「穎」は、“鋭利な知性”を表す。堀越克明の祖父・修一郎が１８７７年に創刊し、明治時代の青少年の啓蒙に寄与した自由投稿誌『穎才新誌』の題名にちなんでいる。
また、EIMEIKANのEMKには、Experience（経験）・Morality（道徳）・Knowledge（知識）という３つの意味を託している。この３つを教育の柱とし、将来は社会の各分野で活躍が期待されるような、高い知性・品性を備えた教養人を育てることを目標に掲げている。

＜教育方針＞
５教科の授業にはとくに十分な時間を充て、中学課程は中学２年までに、高校課程は高校２年までに基本的に修得する。高校からは英語・数学などの授業は、習熟度別クラスごとにおこなう。高校２年になると文・理系の科目選択があるが、国語・数学は十分な時間数を確保し、社会・理科も最低１科目は必修としている。安易に科目を絞らずバランスのとれた学力をつけることで、どのような大学も無理なく目指すことができる。
定期試験は年５回、しかし平常点も重視した評価をしている。平常点には、単元テストや日々の小テスト、レポート、宿題なども含まれる。これにより、通常の授業をより充実させ、教師が生徒の学習到達状況をきめ細かく把握することができる。
放課後には、高学年の希望者対象の大学受験講座や、単元テストなどで基準点に達しなかった生徒のための指名補習などがある。また、１２～１月にはセンター試験直前講習が開かれている。

＜校風＞
生徒の人格を尊重し、その健全な判断力や良識を信頼して、“最大限の自由と最小限のルール”をモットーにしている。人格形成を学力形成と並ぶ車の両輪として重視し、生徒の自主的、主体的な活動を温かくサポートしている。そこからリベラルな校風が生まれ、伸び伸びとした雰囲気が漂っている。
主な学校行事は、別項記載のとおりであるが、なかでも文化祭は、学年・学級による趣向をこらした展示・発表をメインに、その準備には多大の時間と労力が割かれている。
部活動の参加率は、中学生が約９割、高校生が約７割である。運動部の人気が高く、対外試合などで好成績を収める部も増えている。
学校が“知的生活の場”として生徒に大いに活用されるよう、諸施設は１２時間オープンしている。食堂は希望者に対して、軽めの朝食や軽食も用意している。

中学課程を２年生までに修了し、３年生からは高校課程へとなります。進度が速く大変そうに思われがちですが、授業時数をしっかりと確保しており、授業はじっくりと、丁寧に展開されています。単元ごとの小テストなども頻繁に実施され、理解の不充分な生徒には放課後の補習も積極的に行っております。

中学１年　

　国語　６　　社会　５　　数学　６　　理科　４　　英語　６　　（英会話）　１

中学２年

　国語　６　　社会　４　　数学　６　　理科　５　　英語　６　　（英会話）　１

中学３年

　国語　６　　社会　５　　数学　６　　理科　４　　英語　７

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　（週あたりの授業時数）　　　

生徒が志望大学に進学することができるよう、生徒の進路意識を高める６年一貫のキャリア教育の充実に努めている。
２０１２年春の卒業生は１５０人で、現役進学率は１１８名（７９％）。進学先状況は国公立大学４２名（２８％、東京大学７名、東京工業大学２名、北海道大学３名、東北大学２名など）、早慶上智３８名（２５％）、理ＭＡＲＣＨ２１名（１４％）、その他の大学１７名（１１％）である。

○文化祭（９月）─公開

○芸術鑑賞（１１月）

○百人一首大会（１月）

○体育祭（９月）─公開

○中学球技大会（６月）

・中学１年─菅平林間学校（３泊４日）   

  ・中学２年─広島・宮島体験学習（３泊４日）   

・中学３年─奈良・京都体験学習（３泊４日）

給食，食堂，購買・売店，プール，音楽ホール，天体望遠鏡，カウンセラー，外国人講師の授業

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