昭和２２年４月に発足した男女共学の中学校である。福澤諭吉は、はやくから女子教育の重要性を説いていたが、慶應義塾において本格的な女子教育が実施されたのは中等部が最初である。

＜教育方針＞
中等部は、福澤諭吉の「独立自尊」の精神に則り、将来、慶應義塾の大学を卒業して社会の中核の人物になる素地を作ることを目指している。そのために、いろいろな学問の基礎を学び、自ら考え、自ら判断し、自ら行動して、その結果に責任を持てる自立した人間になると同時に、円満な人格と豊かで優しい人間性をもつ人物に育つこと、今日の情報化・国際化の社会にも十分通用する大きな人間像を念頭に置いた教育を施している。

■日常指導の中で重視していること
中等部は学校を小社会と考えている。従って、円滑に社会生活を送るための基本的マナーとして、話し合いの精神を大切にしている。先生も生徒も、互いに自由に対話できるような雰囲気を作ることを心がけている。学校のいたるところで、和やかな会話が行われている光景を見ることができよう。

■学校として新入生に望むこと
どうすればよい高校や大学へ進学できるか、といった勉強はしない。むしろ、高校や大学に行ってどんな勉強をするか、そのために今どうすればよいかを考えながら勉強する。

＜学校の特色＞
通常の教科では、少人数の授業形態、オーディオ・ヴィジュアル教材やコンピュータを駆使した授業など、常に教授法が各教科で工夫されている。また、教科の勉強のほかに、講演会や見学、能楽・落語鑑賞会など、幅広い分野に触れられるように、行事が盛り沢山に組まれている。
中等部には、創立当初から色々な面白い習慣がある。先生を「さん」づけで呼んでもよい。教室には教壇がない。教員室には自由に入ってよい、などなど。まさに「自由で明るく楽しい」学校である。しかし、真に自由であるためには、どのような規律が大切か、また、明るく楽しくあるためには、日常どのような努力が必要か、これらのことを常に考えている。
校友会活動においても、一貫教育の利点が生かされ、部によっては大学から優れたコーチが指導に来ている。

男子は高校（日吉）、志木高校、湘南藤沢高等部、ニューヨーク学院高等部、女子は女子高校、湘南藤沢高等部、ニューヨーク学院高等部のいずれかへ、本人が希望する高校に中等部長の推薦により進学できる。

○展覧会
公開

○運動会
公開

○遠足　4月下旬

○林間学校　7月中旬

○見学　3月中旬

○卒業旅行　3月中旬
九州方面

○海外研修旅行(希望者のみ)
2年次3月下旬
3年次8月中旬

クラブ活動のことを「校友会活動」とよび、学科の授業とともに教育の二つの大きな柱と考えている。現在、運動部１７部、学芸部２３部が活発に活動している。区大会、都大会、関東大会、全国大会で活躍する部が多い。

無