１９０６年、当時学習院教授であった石川角次郎が、米国キリスト教会のH. H.ガイやR. D.マコイ等の協力を得て、神学校並びに旧制中学校をこの地に創立しました。神学校はその後青山学院と合同し、１９４８年、新制中学・高校となりました。高校１５学級（男子普通科）、中学１５学級（男子）。
併設校：聖学院大学・大学院、聖学院小学校、女子聖学院中学・高等学校、聖学院アトランタ国際学校があります。

＜教育方針＞
聖学院は一人ひとりが神からかけがえのない贈物を与えられているという確信に基づき、それぞれ固有な贈物を発見することを助け、個人の人格の完成へ導く教育をします。聖学院教育はナンバーワン教育ではなく、オンリーワン教育であり、そしてそれはオンリーワン・フォー・アザーズ（他者のために生きる個人）の教育です。

【日常指導の中で重視していること】
Advanced ClassとRegular Classの２コース編成を導入し、理数教育の拡充を図り、高い進学目標の達成を目指します。
また英語教育は、米国教会および大学との密接な関係の中で、ホーム・ステイをはじめ語学研修など有効な指導により実力をあげています。
キリスト教関係大学をはじめ一般大学への指定校推薦や聖学院大学と他大学の併願推薦も可能となっています。

【新入生に望むこと】
入学式翌日から３日間にわたる新入生のためのオリエンテーションは、各自の学校生活を充実させるためのものです。クラス作りの方向の中で、新しい友人との出会いを積極的にもち、常にオープンハートで、教師の言葉を聞く姿勢をもつように心がけて下さい。指導される学習計画に基づいて、生活設計をたてることが大切です。

＜特色＞
「椎の木茂る丘」の上に、チャペルアワー（礼拝）の讃美歌が流れ、祈りが捧げられています。聖書科の授業、ボランティア活動、環境問題への取り組みなどを通してキリスト教の精神が生徒諸君の人格形成の豊かさとなり、友人と教師との触れ合いの中に愛と信頼を培っています。また、英語教育をはじめ、各個性に応じた学習活動をもって、広く国際的な視野に立ち、社会に貢献し得る人材の育成に努力しています。

○創立記念際
（入試相談コーナーを設置）
公開

○クリスマス点灯祭

○体育祭
非公開

○修学旅行
糸魚川市　農村体験学習

無